长期以来，该中心围绕华南沿海经济快速发展过程中出现的生态安全问题，重点突出农业环境污染治理技术研究，制订出省地方标准《广东省无公害蔬菜施肥技术规程》，土壤复合污染控制与修复技术已应用于大宝山、莲花山等矿山土壤污染治理，并于2006年在韶关翁源县大宝山上坝村成建了广东省首个治理土壤污染的野外台站“污染土壤改良与修复工程基地”。

近年来，该中心共承担和完成国家和省部级等科研项目30余项，获得省科学技术奖一等奖和二等奖各3项，省专利奖金奖2项，国家环境保护科学技术奖二等奖1项，第六届国际发明展览会金奖和铜奖各1项，发表论文60余篇，专利受理30余件，授权10余件。李芳柏研究员2006~2007年分别获得第十届中国青年科技奖（广东省仅1人获得）、第九届广东省丁颖科技奖、第六届“广东省十大杰出青年”提名奖、省科学院2005~2006年度科技贡献奖、省直机关“岗位排头兵”、省直机关“优秀共产党员”称号。万洪富研究员2007年获得首届“南粤十大环保之星”称号。李淑仪研究员获得2006年全国“三八红旗手”称号。周顺桂副研究员被中国土壤学会授予“首届优秀青年学者奖”荣誉称号(全国共10人获奖)。