2009年，自动化中心根据地方经济社会发展需求，坚持整合资源、集成优势、重点突破的原则，充分结合中心的学科布局和学科优势，加强科研项目的全过程管理工作，在中心领导的高度重视和科研人员的共同努力下，科研工作取得了良好的进展。2009年获各类科研项目20余项，其中具有代表性的包括：联合合作单位共获广东省重大科技专项2项，中标广东省粤港关键领域重点突破项目3项，省院合作项目4项，首次获得省国际合作项目1项。

同时，广东省现代控制与光机电技术公共实验室经过三年建设，于2009年4月顺利通过了省科技厅和广州市科技局组织的验收，并获得正式授牌。2009年，中心与凌华科技（中国）有限公司共建“测量与自动化”联合实验室。通过这些科研平台建设，中心的科研条件得到了明显改善，使科研工作迈上一个新的台阶，进一步提高了中心自主创新能力。